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Projets financés

2025

ANR
  • ANR Mobil-DNA (ANR-24-CE20-6240-03; 2025-2029): T-DNA fate, regulation and impact during Agrobacterium-Arabidopsis interaction. Partners: Denis Faure (coordinator, I2BC, Saclay), Angélique Déléris (I2BC, Saclay) et Frédéric Pontvianne.
  • ANR-NIDROROX (2025-2028)
  • ANR FAGRESCUE (2025-2028): Une approche transdisciplinaire impliquant l'intelligence artificielle, la génomique et la modélisation écologique pour améliorer la résilience des hêtraies dans le contexte du changement climatique. LGDP leader (Olivier Panaud), Partenaires:  ONERA (DOTA), CEFE, INRAE. 

2024

ANR
  • ANR PolyPMD (01/2024-06/2028): Antagonism between Plant Mobile Domain-containing proteins and Polycomb-mediated gene silencing. Partners: Olivier Mathieu (coordinator, iGred, Clermont-Ferrand) and Guillaume Moissiard.
  • ANR DYSCORD (ANR-23-CE20-0036-03; 2024-2028): Dynamics of chromosome organization during reproductive development. Partners: Mathieu Ingouff (coordinator, IRD, Montpellier), Mathilde Grelon (IJPB, INRAe Versailles) et Frédéric Pontvianne.
Projets européens et internationaux
Autres projets
  • Projet Innovant Fondation UPVD (Appel à projets 2024) : PI Marie Mirouze, partenaire société ACOBIOM. 
  • Projet Innovation Labex TULIP DROPHENO : Combiner l'imagerie par drone, l'intelligence artificielle et l'écologie de terrain pour concevoir une stratégie de phénotypage à haut débit des forêts de hêtres. Partenaire: Bionomeex 
  • Projet pilote BioDivOc FAGADAPT (Appel à projets 2024). Adaptation des forêts tempérées au changement climatique. Une étude de cas combinant génomique et écologie pour suivre l’adaptation à court terme de la hêtraie dans la réserve de la Massane. LGDP leader (Olivier Panaud), Partenaires:  CEFE, BIOM, Réserve Naturelle de la Massane. 
  • Projet Fondation UPVD (2024) – EUPHYDRYAS - Approches multi-omiques innovantes pour la conservation de la dernière population d’Euphydryas desfontainii en France. PI : Nathalie Tapissier, Cédric Bertrand et Joris Bertrand. 
  • Projet Bonus Qualité Recherche (BQR) UPVD (2024) - Transcriptomique comparative pour étudier les causes d’un manque récurrent de floraison dans la flore emblématique des Pyrénées. PI : Valérie Hinoux et Joris Bertrand.
  • Projet Bonus Qualité Recherche/BQR UPVD (2024-25) - La voie R-met, régulateur global de l’immunité chez les plantes ? Jacinthe Azevedo-Favory.
  • Projet Fédération de Recherche en Écologie & Environnement UPVD (2024) – Modélisation des niches écologiques - Mise en place d’un pipeline pour la modélisation des niches écologiques des espèces emblématiques de la flore pyrénéenne et prédiction des niches futures selon différents scénarios et échelles temporelles. PI : Valérie Hinoux, Sébastien Pinel & Joris Bertrand. 
  • Projet Fédération de Recherche en Écologie & Environnement UPVD (2024) – Médiation chimique et pâturage - Rôle de la médiation chimique et impact du stress lié au pâturage dans la relation entre un papillon menacé (Euphydryas desfontainii) et sa plante-hôte (Cephalaria leucantha). PI : Nathalie Tapissier, Cédric Bertrand & Joris Bertrand.
  • Projet Fédération de Recherche en Écologie & Environnement UPVD (2024) : Dynamiques Salariales et Sociales/Sociétales dans le territoire des Pyrénées-Orientales (DySSPO). Modélisation globale de données et obtention d'un système d'équations différentielles. Coordinateurs : Vincent Lignon (UPVD, Perpignan) et Martin Rosalie (UPVD/CNRS, Perpignan).

2023


ANR
  • ANR MUSAWALL (2023-2028). Rôle et mécanismes d'action des protéines de type Musashi dans le contrôle de la synthèse des polysaccharides de la paroi secondaire chez les plantes. Coordinateur : Thierry Lagrange (LGDP, CNRS), Partenaires : Richard Sibout (BIA, CNRS/INRAe) ; Fabien Mounet (LRSV, UT3).

2022

ANR
  • ANR Epi-tRNA (2022-2026): Dynamique de l'épitranscriptome des tRNA: Conséquences phénotypiques et moléculaires sur le développement des plantes et leur réponse aux stress. Partenaires: JM Deragon (CNRS/UPVD, Perpignan), L. Drouard-Maréchal (CNRS, Strasbourg), C. Hirtz (CHU, Montpellier)
  • ANR PHYTOMICS (2022 - 2027) : Interactions phytoplankton-virus: des bases moléculaires de la résistance aux virus à leurs dynamiques éco-évolutives. Coordinateur : Sébastien Gourbiere (UPVD/CNRS, Perpignan), Partenaires : Gwenael Piganeau (CNRS, Banyuls sur mer) et Didier STIEN (SU/CNRS, Banyuls sur Mer).
  • ANR ELVIRA (2022 - 2026) : Ecogénomique des interactions phytoplancton-virus en réponse aux variations des facteurs abiotiques (salinité et phosphate). Coordinatrice : Gwenael Piganeau (CNRS, Banyuls sur mer), Partenaires : Sébastien Gourbiere (UPVD/CNRS, Perpignan) et Elisa Schaum (HU, Hambourg).
Autres projets
  • New Frontiers TULIP LabEx (06/2022-12/2024): Impact of transposons on plant adaptation and development by alternative splicing. Coordinators: Nathalie Picault and Guillaume Moissiard.
  • Projet pilote BioDivOc FAGADAPT (Appel à projets 2024). Adaptation des forêts tempérées au changement climatique. Une étude de cas combinant génomique et écologie pour suivre l’adaptation à court terme de la hêtraie dans la réserve de la Massane. LGDP leader (Olivier Panaud), Partenaires: CEFE, BIOM, Réserve Naturelle de la Massane.
  • Projet Consortium BioDivOc ‘DevocGen’ (2022-2025) - Développement et applications de nouveaux outils pour la gestion et la conservation des populations naturelles sur la base de données génomiques. PI S. Boitard & R. Leblois – Partenaires : P.-A. Gagnaire, L. Chikhi, P.-A. Crochet, S. Blanchet & J. Bertrand.
  • Projet Central Labex TULIP (2022) – Analyse fonctionnelle de protéines de type Musashi chez Arabidopsis thaliana. Natacha Bies-Etheve.
  • Projet Fédération de Recherche en Écologie & Environnement UPVD (2022) : Analyse de la dynamique d’Ostreococcus en co-évolution avec des virus. Modélisation individus-centrés à l'aide de l'algorithme de Gillespie. Coordinateur : Martin Rosalie (UPVD/CNRS, Perpignan), Partenaires : Sébastien Gourbière (UPVD/CNRS, Perpignan), Assalé Adjé (UPVD, Perpignan) et David Defour (UPVD, Perpignan).

2021

ANR
  • ANR MetRibo (05/2021 - 10/2025) : Tackling rRNA Methylation: Molecular Bases and Ribosome Translational Impact: Partners: J. Sáez-Vásquez (CNRS/UPVD, Perpignan), I. Motorin (U. de Lorraine, Strasbourg); C. Gaspin (INRA, Toulouse).
  • ANR Matilda (2021 - 2025) : Mécanisme moléculaire et importance physiologique de la dégradation 5'-3' co-traductionnelle des ARNm chez Arabidopsis. Partenaires: R. Merret (CNRS/UPVD, Perpignan), D. Gagliardi (CNRS, Strasbourg)
  • ANR RoxRNase (04/2021 - 09/2025) : Redox regulation in small RNA-mediated responses to biotic and abiotic stresses. Partners J-P. Reichheld (CNRS/UPVD, Perpignan); J. Sáez-Vásquez (CNRS/UPVD, Perpignan), H. Vaucheret (INRA, Versailles. CES12 Genetic, Genomic and RNA).
  • ANR Exotica (12/2021 - 12/2025) :  Explorer l'étendue, les voies et le devenir des transferts horizontaux dans les génomes nucléaires des plantes. Coordinateur : M. El Baidouri (CNRS/UPVD, Perpignan)
  • ANR Diversifly (12/2021 - 12/2025) : Diversification adaptative des orchidées mouches comme modèle pour étudier la spéciation écologique et les radiations adaptatives. Coordinateur : J. Bertrand (UPVD/CNRS, Perpignan)
  • ANR PRCI CropCircle (2021-2025) Mobilome, adaptation et stabilité du génomes chez les plantes cultivées. Partenaires : Marie Mirouze (IRD, Perpignan) et Etienne Bucher (Suisse)
  • ANR-RoxRNase (2021-2025) Régulation redox de la réponse aux stress biotiques et abiotiques médiée par les petits ARNs
Projets Européens et Internationaux
  • EpiDiverse (2027-2021) Projet Européen MCSA European Training Network grant, EU H2020 Marie Skłodowska-Curie No 764965 EpiDiverse
Autres projets
  • Projet Innovation Labex TULIP (2021) : Etudier la diversité génétique et la production de composés biofongicides à partir de différentes populations de Dittrichia viscosa du pourtour méditerranéen. PI Fred Pontvianne, Partenaire M Mirouze. 
  • Projet INSB (CNRS) DICOHOT (2021-2022) : Fréquence et impact des transferts horizontaux chez Dioscorea communis. PI Moaine El Baidouri.

2020

ANR
  • ANR-REPHARE (2020-2025) Régulation redox de l'activité des HDAC de plantes en réponse au changement climatique
Projets Européens et Internationaux
Autres projets
  • Projet Central Labex TULIP (2020) : Comprendre le rôle du lierre commun (Hedera helix) dans les transferts horizontaux entre arbres. PI Moaine El Baidouri.
  • Projet Fédération de Recherche en Écologie & Environnement UPVD (2020) – Étude intégrative de l’état de santé des populations naturelles du Grand Tétras (Tetrao urogallus aquitanicus), espèce emblématique localement menacée d’extinction.PI : Olivier Rey, Valérie Hinoux & Joris Bertrand.
  • Projet Fédération de Recherche en Écologie & Environnement UPVD (2020) – Conservation d’espèces emblématiques - Développement d’une approche intégrative pour la conservation des espèces emblématiques – Étude pilote sur le couple Ophrys catalaunica / O. magniflora. PI : C. Bertrand & J. Bertrand.
  • Projet Fondation Biotope (2020) – REORDER - Phylogénie moléculaire haute résolution des orchidées Ophrys en France. PI : Joris Bertrand, Errol Véla, Etienne Delannoy & Frédéric Melki 
  • Projet Central Labex TULIP (2020) - Analyse de l'impact de l'enzyme PRMT5 sur la protéine AGO1 chez A. thaliana. Jacinthe Azevedo-favory.

2019

Autres projets
  • Projet Inter-LabEx TULIP & CEMEB (2019) – Distribution géographique des Ophrys aveyronensis - Étude pilote sur la distribution géographique disjointe d’Ophrys aveyronensis, espèce endémique et menacée : causes et implications. PI : Joris Bertrand & Bertrand Schatz
  • ​​​​​​​Projet Bonus Qualité Recherche (BQR) UPVD (2019) – Radiation adaptative des Ophrys - Étude des bases génomiques de la radiation adaptative des orchidées Ophrys euro-méditerranéennes. PI Joris Bertrand.

2018 et avant

ANR
  • ANR Heat-EpiRNA (2018-2022): Modifications des extrémités 3' des ARNm par addition de nucléotides: impact sur la traduction et la dégradation des ARNm chez Arabidopsis thaliana. Partenaires: C. Bousquet-Antonelli (CNRS/UPVD, Perpignan), A. Verdel (CNRS/INSERM/UGA, Grenoble)
  • ANR RiboStress (01/2018-12/2021). Genetic, epigenetic and protein-based crosstalks between nucleolus functional reorganization and response to stress. Partners: J. Sáez-Vásquez (CNRS/UPVD, Perpignan) F. Barneche (ENS, Paris), C. Carapito (CNRS/U de Strasbourg) and F. Le Galliard (CEREEP-ECOTRON IDF).
  • ANR ALGALVIRUS (2017-2022). Adaptations Génomique des Algues Marines aux Virus. Coordinateur Nigel Grimsley (BIOM,CNRS), Partenaires: Thierry Lagrange (LGDP, CNRS); Olivier Jaillon (Genoscope, CEA).
  • ANR 3'ModRN (2016-2021): Lecture de l'épitranscriptome du stress thermique chez Arabidopsis. Partenaires: D. Gagliardi (CNRS, Strasbourg), C. Bousquet-Antonelli (CNRS/UPVD, Perpignan)
  • ANR Heat-Adapt (2014-2019) Régulation post-transcriptionnelle de la réponse au stress thermique chez la plante. Partenaires: J.M. Deragon (CNRS/UPVD, Perpignan), Y.Y. Charng (ABRC, Taipei)
  • ANR JCJC EXTRACHROM (2014-2017) Contrôle épigénétique des formes extrachromosomiques des éléments transposables chez les plantes. Coordinatrice : Marie Mirouze (IRD, Perpignan)
Projets Européens et Internationaux
  • Projet Européen MCSA EpiDiverse European Training Network grant (2017-2021)

Mise à jour le 21 mars 2025
https://lgdp-pro.univ-perp.fr/recherche/projets-finances